校友講堂-基因表達測定方法進展、評析與創新

發布時間:2016-11-04瀏覽次數:1346

2016年10月27日,在万博英超狼队网官方网 A208會議室,哥倫比亞大學醫學院資深研究員、我院66屆校友徐定邦先生給眾多校友和在校學生們做了題為“基因表達測定方法進展、評析與創新:從哈佛PrimerBank到CELL一篇RNA-seq論文”的學術報告。

作為PCR專家,徐定邦先生講述他近期對基因定量的研究發展,他介紹說qRT-PCR、芯片和RNA-seq 是當前基因表達分析的三項主要技術,各有優勢和弱點,也存在一些共同問題。例如:哈佛大學和伯樂公司等含有幾十萬對引物順序和經Sybr Green I或TaqMan qRT-PCR驗證結果,雖然為研究者提供了極大方便,但40%引物對的正、反引物位於同一外顯子,因而可能存在受gDNA幹擾的嚴重問題。作為基因表達研究主流的Δ ΔCt方法依賴實際上表達並不恒定的GAPDH、-actin 等持家基因,也存在嚴重缺陷。公用數據庫已存有約100萬套用芯片技術得到的數據,但幾年前MIT 的科學家提出,由於不同細胞的總RNA 含量並不相同因而對上百萬套數據的可靠性和價值需要全盤重新考慮。

徐定邦先生同時提出,具有革命性意義的RNA-seq  在基因定量、SNP發現和檢測、剪切變異發現等方麵的高通量優點不容置疑,但是定量準確性、檢測低表達基因、和微量體細胞突變的能力等方麵則仍遠不及qRT-PCR。然而,每個細胞中的mRNA拷貝數是具有明確生物學意義的理想的基因表達單位,但由於種種技術上的困難應用上述表達單位的論文少之又少更沒有任何數據庫被建立。

徐定邦先生研究出一項創新的、以“mRNA/細胞”表示的RT-PCR測定基因表達水平的方法,克服了現有方法的缺陷,已提交PCT專利申請。

複旦生科院全球校友會常務副會長盧大儒教授對徐定邦先生能在百忙之中來到我院做講座,覺得十分開心和榮幸,在盧老師看來,徐定邦先生的基因定量方法十分獨特,希望雙方有進一步的交流和合作。

講座結束,盧大儒教授授予徐定邦先生感謝狀,感謝徐先生為生科院學生和校友帶來如此精彩的講座。

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