教師基本信息
姓名：黃強
職稱：教授
職務：教師
電子郵箱：huangqiang@fudan.edu.cn
辦公地點：G607室
辦公電話：021-31246589
研究方向
生物大分子設計與優化、基因編輯係統的機理與調控、蛋白質人工智能設計技術。
個人簡介
1991年從浙江大學化學係本科畢業，獲得化學專業學士學位。隨後，於1994年和1998年分別在浙江大學獲得物理化學專業的碩士和博士學位。1999至2000年間，在德國柏林洪堡大學生物係分子生物物理專業從事博士後研究，並於2001至2003年間繼續在該係及台灣中山大學化學係進行研究。2004年12月進入万博英超狼队网官方网 工作，主要開展生物分子結構與相互作用的理論建模、計算模擬和分子設計等前沿研究。自2005年起，曆任副教授、教授，並擔任博士生導師。
近年來，其課題組專注於結合分子結構模擬、人工智能計算與基因工程實驗，進行蛋白質設計與優化的研究，是國內少數深度融合蛋白質計算設計與基因工程實驗研究的團隊之一。已在J. Am. Chem. Soc., Nature Commun., Biosens. Bioelectron., Protein Cell, J. Nanobiotech.和Bioinformatics等知名期刊上發表了近90篇學術論文，獲得了近20項授權發明專利，曾獲得第五屆中國技術市場協會金橋獎(第二完成人), 教育部技術發明獎二等獎(第三完成人)和上海市科技發明獎二等獎 (第三完成人)。
授課情況
生物技術專業課《物理化學》、生物學專業進階課《計算結構生物學》。
招生專業
生物信息學、遺傳學
1. Q. Qin, X. Jiang, L. Huo, J. Qian, H. Yu, H. Zhu, W. Du, Y. Cao, X. Zhang, Q. Huang*. Computational design and engineering of self-assembling multivalent microproteins with therapeutic potential against SARS-CoV-2. Journal of Nanobiotechnology. 22:58 (2024). https://doi.org/10.1186/s12951-024-02329-3.
2. X. Jiang, Q. Qin, H. Zhu, J. Qian, Q. Huang*. Structure-guided design of a trivalent nanobody cluster targeting SARS-CoV-2 spike protein. International Journal of Biological Macromolecules, 256:128191 (2024). https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2023.128191.
3. M. Song, Y. Li, R. Gao, J. Liu, Q. Huang*. De novo design of DNA aptamers that target okadaic acid (OA) by docking-then-assembling of single nucleotides.Biosensors & Bioelectronics, 215:114562 (2022). https://doi.org/10.1016/j.bios.2022.114562.
4. R. Yao, J. Qian, Q. Huang*. Deep-learning with synthetic data enables automated picking of cryo-EM particle images of biological macromolecules. Bioinformatics, 36:1252-1259 (2020). https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz728.
5. Q. Liu, A. Herrmann, Q. Huang*. Surface binding energy landscapes affect phosphodiesterase isoform-specific inhibitor selectivity. Computational & Structural Biotechnology Journal，17:101-109 (2019). https://doi.org/10.1016/j.csbj.2018.11.009.
6. C. Huai#, G. Li#, R. Yao, Y. Zhang, M. Cao, L. Kong, C. Jia, H. Yuan, H. Chen, D. Lu*, Q. Huang*. Structural insights into DNA cleavage activation of CRISPR-Cas9 system. Nature Communications, 8:1375 (2017). https://doi.org/10.1038/s41467-017-01496-2.
7. J. Zhu, Q. Yang, D. Dai, Q. Huang*. X-ray crystal structure of phosphodiesterase 2 in complex with a highly selective, nanomolar inhibitor reveals a binding-induced pocket important for selectivity. Journal of the American Chemical Society, 135: 11708-11711 (2013). https://doi.org/10.1021/ja404449g.
8. Q. Huang*, A. Herrmann. Calculating pH-dependent free energy of proteins by using Monte Carlo protonation probabilities of ionizable residues. Protein & Cell, 3:230-238 (2012). https://doi.org/10.1007/s13238-012-2035-4.
9. Q. Huang, C.- L. Chen, A. Herrmann. Bilayer conformation of fusion peptide of influenza virus hemagglutinin: a molecular dynamics simulation study. Biophysical Journal, 87:14-22 (2004). https://doi.org/10.1529/biophysj.103.024562.
10. Q. Huang, R. Opitz, E.-W. Knapp, A. Herrmann. Protonation and stability of the globular domain of influenza virus hemagglutinin. Biophysical Journal, 82:1050-1058 (2002). https://doi.org/10.1016/S0006-3495(02)75464-7.