田衛東

發布者：王詩銘發布時間：2021-07-01瀏覽次數：1203

教師基本信息

姓名：田衛東

職稱：教授

電子郵箱：weidong.tian@fudan.edu.cn

辦公地點：生科樓G609

辦公電話：021-31246723


研究方向

生物信息學方法開發和應用，包括疾病編碼變異和非編碼調控序列變異的篩選及臨床表型數據分析的算法開發和應用，單細胞數據的分析方法開發和臨床應用， RNA編輯和基因轉錄調控，生物通路和生物網絡的分析方法開發和應用等。


個人簡介

1995年上海交通大學本科，1998年清華大學碩士，2004年美國華盛頓大學（聖路易斯）博士，2005-2008年美國哈佛大學醫學院博士後。2008年起万博英超狼队网官方网 教授，博導，狗万外围充值 遺傳工程國家重點實驗室PI，2009年起狗万外围充值 附屬兒科醫院兼職PI，2018年起山東大學齊魯兒童醫院兼職PI。上海浦江人才，上海曙光學者。中國細胞生物學學會功能基因組信息學與係統生物學分會理事，中國衛生生產企業管理協會精準醫療分會常務理事等。


授課情況

組學數據統計和分析（本科、研究生），生物統計學方法和應用（研究生）


招生專業

生物統計學、生物信息學


代表性論文和論著

  1. Zhang, F., Li, X., Tian, W#. (2020) Unsupervised Inference of Developmental Directions for Single Cells Using VECTOR. Cell Rep. 2020 Aug 25;32(8):108069.  doi: 10.1016/j.celrep.2020.108069. (PMID: 32846127)

  2. Zhang, F., Wu, Y., Tian, W#. (2019) A novel approach to remove the batch effect of single-cell data. Cell Discovery. 2019 Sep 24;5:46. doi: 10.1038/s41421-019-0114-x. (PMID: PMC6796914)

  3. Li, Z*., Zhang, F*., Wang, Y., Qiu, Y., Wu, Y., Lu, Y., Yang, L., Qu, W.J., Wang, H., Zhou, W.#, and Tian W#.(2019) PhenoPro: A novel toolkit for assisting in the diagnosis of Mendelian diseases. Bioinformatics. 2019 Feb 19. pii: btz100. doi: 10.1093/bioinformatics/btz100 (PMID: 30843052)

  4. Zhang, F., Lu, Y., Yan, S., Xing, Q., Tian W#. (2017) SPRINT: an SNP-free toolkit for identifying RNA editing sites. Bioinformatics. July 24; DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx473. (PMID: 29036410)

  5. Chen, J. and Tian, W.# (2016) Explaining the disease phenotype of intergenic SNP through predicted long range regulation. Nucleic acids research, 44, 8641-8654. (PMID: 27280978)

  6. Dong, X., Wang, X., Zhang, F. and Tian, W#. (2016) Genome-Wide Identification of Regulatory Sequences Undergoing Accelerated Evolution in the Human Genome. Molecular Biology and Evolution, 33, 2565-2575. (PMID: 27401230)

  7. Gong, Q., Ning, W. and Tian, W#. (2016) GoFDR: A sequence alignment based method for predicting protein functions. Methods, 93, 3-14. (PMID: 26277418)

  8. Chang, B.H. and Tian, W.# (2016) GSA-Lightning: ultra-fast permutation-based gene set analysis. Bioinformatics, 32, 3029-3031. (PMID: 27296982)

  9. 田衛東，趙興明.《生物信息學與功能基因組學》化學工業出版社,2020年1月

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